Sai sót khi áp dụng Thông tư 99 dưới góc nhìn kiểm toán

Từ ngày 01/01/2026, Thông tư 99/2025/TT-BTC chính thức thay thế Thông tư 200/2014/TT-BTC, đánh dấu sự thay đổi quan trọng trong chế độ kế toán doanh nghiệp tại Việt Nam. Việc chuyển đổi không chỉ ảnh hưởng đến hệ thống tài khoản, báo cáo tài chính và quy trình kế toán mà còn tác động trực tiếp đến công tác kiểm toán. Trong năm đầu áp dụng, nhiều doanh nghiệp có thể gặp khó khăn do chưa cập nhật đầy đủ quy định mới hoặc chưa điều chỉnh đồng bộ quy trình và hệ thống kiểm soát nội bộ. AGS sẽ phân tích những sai sót doanh nghiệp thường gặp khi chuyển sang Thông tư 99, đồng thời chia sẻ góc nhìn của kiểm toán viên và các giải pháp giúp hạn chế rủi ro trong bài viết này.
Những sai sót có thể gặp

1. Vì sao việc chuyển sang Thông tư 99 dễ phát sinh sai sót?

Việc thay đổi chế độ kế toán luôn là một quá trình phức tạp, đặc biệt đối với những doanh nghiệp đã vận hành theo Thông tư 200 trong nhiều năm. Không chỉ thay đổi về biểu mẫu báo cáo tài chính, Thông tư 99 còn điều chỉnh nhiều nội dung liên quan đến hệ thống tài khoản, nguyên tắc trình bày thông tin và phương pháp xử lý một số nghiệp vụ kế toán. Trên thực tế, không ít doanh nghiệp cho rằng việc chuyển đổi chỉ đơn giản là cập nhật phần mềm kế toán hoặc đổi tên một số chỉ tiêu trên báo cáo tài chính. Tuy nhiên, quá trình này còn liên quan đến việc rà soát quy trình kế toán, đánh giá lại hệ thống kiểm soát nội bộ, đào tạo nhân sự và kiểm tra tính nhất quán của số liệu giữa các kỳ kế toán. Nếu việc chuyển đổi không được chuẩn bị kỹ lưỡng, doanh nghiệp có thể phát sinh nhiều sai sót làm ảnh hưởng đến chất lượng thông tin tài chính. Đối với kiểm toán viên, năm đầu tiên áp dụng chế độ kế toán mới cũng là thời điểm có mức độ rủi ro kiểm toán cao hơn so với các năm trước.

2. Những sai sót doanh nghiệp thường gặp khi chuyển từ Thông tư 200 sang Thông tư 99.

2.1. Chỉ thay đổi biểu mẫu mà không rà soát bản chất nghiệp vụ.

Nhiều doanh nghiệp tập trung cập nhật mẫu báo cáo tài chính nhưng vẫn duy trì cách ghi nhận và phân loại nghiệp vụ theo quy định cũ. Điều này khiến báo cáo tài chính tuy đúng về hình thức nhưng chưa phản ánh đúng yêu cầu của chế độ kế toán mới.

Góc nhìn của kiểm toán viên: Khi lập kế hoạch kiểm toán, kiểm toán viên không chỉ kiểm tra hình thức của báo cáo tài chính mà còn đánh giá liệu doanh nghiệp đã thực sự áp dụng đúng các nguyên tắc kế toán mới hay chưa. Nếu phát hiện doanh nghiệp chỉ thay đổi tên chỉ tiêu nhưng chưa thay đổi cách ghi nhận hoặc trình bày, kiểm toán viên sẽ mở rộng phạm vi thử nghiệm và đánh giá lại mức độ rủi ro của khoản mục liên quan.

2.2. Không cập nhật hệ thống tài khoản kế toán đồng bộ.

Việc cập nhật không đồng bộ giữa phần mềm kế toán, hệ thống tài khoản và dữ liệu kế toán có thể dẫn đến sai lệch giữa sổ chi tiết, sổ cái và báo cáo tài chính. Đối với doanh nghiệp có nhiều chi nhánh, nguy cơ chênh lệch khi hợp nhất báo cáo càng lớn.

Góc nhìn của kiểm toán viên: Kiểm toán viên thường tăng cường đối chiếu giữa sổ cái, sổ chi tiết và báo cáo tài chính nhằm phát hiện sai lệch phát sinh từ quá trình chuyển đổi dữ liệu. Đồng thời, các kiểm soát công nghệ thông tin liên quan đến việc cập nhật phần mềm kế toán cũng sẽ được đánh giá kỹ hơn.

2.3. Không đánh giá ảnh hưởng đến số dư đầu kỳ.

Số dư đầu kỳ là cơ sở để lập báo cáo tài chính trong năm đầu áp dụng Thông tư 99. Nếu doanh nghiệp không thực hiện điều chỉnh hoặc đối chiếu đầy đủ, sai lệch có thể kéo dài sang các kỳ kế toán tiếp theo.

Góc nhìn của kiểm toán viên: Kiểm toán viên sẽ thực hiện các thủ tục đối với số dư đầu kỳ, bao gồm đối chiếu với báo cáo tài chính năm trước, kiểm tra các bút toán chuyển đổi và đánh giá tính hợp lý của các điều chỉnh phát sinh.

2.4. Chưa cập nhật quy trình kế toán và hệ thống chứng từ.

Nhiều doanh nghiệp đã điều chỉnh phần mềm kế toán nhưng chưa sửa đổi quy trình nghiệp vụ, biểu mẫu chứng từ hoặc quy chế tài chính. Điều này làm tăng nguy cơ ghi nhận không thống nhất giữa các bộ phận.

Góc nhìn của kiểm toán viên: Trong quá trình tìm hiểu hệ thống kiểm soát nội bộ, kiểm toán viên không chỉ xem xét số liệu kế toán mà còn đánh giá các quy trình liên quan đến việc lập, kiểm tra và phê duyệt chứng từ. Nếu phát hiện quy trình chưa được cập nhật đồng bộ, kiểm toán viên có thể đánh giá rủi ro kiểm soát ở mức cao hơn và tăng cường các thủ tục kiểm tra chi tiết đối với những khoản mục có liên quan.

2.5. Thiếu đào tạo nhân sự kế toán về quy định mới.

Việc áp dụng thói quen hạch toán theo Thông tư 200 trong khi chưa nắm rõ quy định mới có thể dẫn đến sai sót trong ghi nhận và trình bày báo cáo tài chính.

Góc nhìn của kiểm toán viên: Kiểm toán viên thường đánh giá năng lực của đội ngũ kế toán thông qua quá trình trao đổi nghiệp vụ, kiểm tra hồ sơ và xem xét cách doanh nghiệp xử lý các giao dịch phát sinh. Nếu nhận thấy nhân sự chưa nắm rõ quy định mới hoặc áp dụng không nhất quán, kiểm toán viên sẽ xác định đây là một yếu tố làm gia tăng rủi ro sai sót trọng yếu và điều chỉnh kế hoạch kiểm toán cho phù hợp.

2.6. Chưa điều chỉnh hệ thống kiểm soát nội bộ.

Thay đổi chế độ kế toán kéo theo yêu cầu cập nhật quy trình phê duyệt, đối chiếu dữ liệu và phân quyền trên phần mềm kế toán. Nếu các hoạt động kiểm soát vẫn được duy trì như trước, doanh nghiệp có thể đối mặt với nguy cơ sai sót hoặc gian lận.

Góc nhìn của kiểm toán viên: Trong giai đoạn lập kế hoạch kiểm toán, kiểm toán viên sẽ xem xét liệu doanh nghiệp đã cập nhật các hoạt động kiểm soát sau khi áp dụng Thông tư 99 hay chưa. Nếu hệ thống kiểm soát nội bộ không được điều chỉnh phù hợp, kiểm toán viên có thể giảm mức độ tin cậy vào các kiểm soát của doanh nghiệp và tăng quy mô kiểm tra chi tiết đối với các khoản mục có rủi ro cao.

2.7. Sai sót trong trình bày và thuyết minh báo cáo tài chính.

Một số doanh nghiệp chỉ tập trung vào tính chính xác của số liệu mà chưa chú trọng việc cập nhật nội dung thuyết minh theo quy định mới. Điều này có thể khiến báo cáo tài chính chưa đáp ứng đầy đủ yêu cầu công bố thông tin.

Góc nhìn của kiểm toán viên: Trong quá trình hoàn thành cuộc kiểm toán, kiểm toán viên sẽ rà soát toàn bộ việc trình bày và công bố thông tin trên báo cáo tài chính để bảo đảm tuân thủ quy định hiện hành. Những thiếu sót trong phần thuyết minh, dù không ảnh hưởng đến số liệu, vẫn có thể được yêu cầu điều chỉnh trước khi phát hành báo cáo kiểm toán.

3. Doanh nghiệp cần làm gì để hạn chế sai sót khi áp dụng Thông tư 99?

Việc chuyển đổi từ Thông tư 200 sang Thông tư 99 không chỉ là yêu cầu tuân thủ pháp luật mà còn là cơ hội để doanh nghiệp rà soát và nâng cao chất lượng công tác kế toán. Nếu có kế hoạch triển khai phù hợp, doanh nghiệp không chỉ giảm thiểu sai sót trong năm đầu áp dụng mà còn xây dựng được nền tảng quản trị tài chính hiệu quả hơn trong dài hạn.

3.1. Xây dựng kế hoạch chuyển đổi chi tiết.

Doanh nghiệp nên lập kế hoạch chuyển đổi ngay từ đầu năm tài chính, xác định rõ các công việc cần thực hiện, thời gian hoàn thành và bộ phận chịu trách nhiệm. Kế hoạch này nên bao gồm việc rà soát quy định mới, cập nhật hệ thống tài khoản, điều chỉnh phần mềm kế toán, sửa đổi quy trình nghiệp vụ và chuẩn bị báo cáo tài chính theo mẫu mới. Đối với doanh nghiệp có nhiều chi nhánh hoặc công ty con, việc xây dựng lộ trình triển khai thống nhất sẽ giúp hạn chế tình trạng áp dụng không đồng bộ giữa các đơn vị.

3.2. Rà soát toàn bộ quy trình kế toán và kiểm soát nội bộ.

Bên cạnh việc cập nhật quy định pháp lý, doanh nghiệp cần xem xét lại toàn bộ quy trình xử lý nghiệp vụ, từ khâu lập chứng từ, phê duyệt, ghi nhận đến đối chiếu và lập báo cáo tài chính. Đây cũng là thời điểm phù hợp để đánh giá hiệu quả của hệ thống kiểm soát nội bộ. Nếu phát hiện những điểm chưa phù hợp, doanh nghiệp nên điều chỉnh ngay nhằm giảm thiểu rủi ro sai sót hoặc gian lận trong quá trình ghi nhận và trình bày thông tin tài chính.

3.3. Đào tạo và cập nhật kiến thức cho nhân sự.

Con người luôn là yếu tố quyết định sự thành công của quá trình chuyển đổi. Vì vậy, doanh nghiệp nên tổ chức các chương trình đào tạo về Thông tư 99 cho đội ngũ kế toán, nhân viên tài chính và các bộ phận có liên quan. Ngoài việc phổ biến các quy định mới, các buổi đào tạo nên tập trung vào những tình huống thực tế, hướng dẫn cách xử lý nghiệp vụ và các lỗi thường gặp. Điều này sẽ giúp nhân sự hiểu đúng quy định và áp dụng thống nhất trong toàn doanh nghiệp.

3.4. Kiểm tra hệ thống phần mềm kế toán.

Hiện nay, phần lớn doanh nghiệp sử dụng phần mềm để xử lý dữ liệu kế toán. Vì vậy, việc cập nhật phần mềm cần được thực hiện đồng bộ với các thay đổi của Thông tư 99. Trước khi đưa vào vận hành chính thức, doanh nghiệp nên kiểm tra các chức năng hạch toán, kết chuyển, lập báo cáo tài chính và xuất dữ liệu nhằm bảo đảm hệ thống hoạt động chính xác. Nếu phát hiện lỗi, cần phối hợp với nhà cung cấp phần mềm để khắc phục kịp thời, tránh ảnh hưởng đến dữ liệu kế toán trong kỳ.

3.5. Chủ động trao đổi với kiểm toán viên.

Doanh nghiệp không nên chờ đến khi kết thúc năm tài chính mới trao đổi với đơn vị kiểm toán. Việc tham khảo ý kiến kiểm toán viên ngay từ giai đoạn chuyển đổi sẽ giúp doanh nghiệp nhận diện sớm các vấn đề có thể phát sinh và có biện pháp xử lý phù hợp. Bên cạnh đó, kiểm toán viên cũng có thể đưa ra những khuyến nghị về hồ sơ cần chuẩn bị, tài liệu cần lưu trữ và các thủ tục kiểm soát cần tăng cường để quá trình kiểm toán diễn ra thuận lợi hơn.

4. Kết luận.

Việc chuyển từ Thông tư 200 sang Thông tư 99 là một bước thay đổi quan trọng đối với công tác kế toán của doanh nghiệp. Bên cạnh những lợi ích về việc chuẩn hóa thông tin tài chính và nâng cao chất lượng quản trị, quá trình chuyển đổi cũng tiềm ẩn nhiều rủi ro nếu doanh nghiệp chưa chuẩn bị đầy đủ về quy trình, nhân sự và hệ thống kiểm soát nội bộ. Từ góc nhìn của kiểm toán viên, các sai sót trong năm đầu áp dụng thường không chỉ xuất phát từ việc hiểu chưa đúng quy định mà còn do doanh nghiệp chưa triển khai đồng bộ giữa quy trình kế toán, phần mềm, chứng từ và công tác đào tạo. Vì vậy, doanh nghiệp cần chủ động xây dựng kế hoạch chuyển đổi, thường xuyên rà soát việc tuân thủ và phối hợp với kiểm toán viên để kịp thời phát hiện, xử lý các vấn đề phát sinh. Một quá trình chuyển đổi được thực hiện bài bản sẽ không chỉ đáp ứng yêu cầu của Thông tư 99 mà còn góp phần nâng cao tính minh bạch, độ tin cậy của báo cáo tài chính và hiệu quả quản trị trong dài hạn.

Nguồn: https://thuvienphapluat.vn/van-ban/Doanh-nghiep/Thong-tu-99-2025-TT-BTC-huong-dan-Che-do-ke-toan-doanh-nghiep-565484.aspx

Thông tin khác

Next Post Previous Post