Các Phương Thức Nộp Thuế Điện Tử Năm 2025 Cho Hàng Hóa Xuất Nhập Khẩu
Từ ngày 07/08/2025, Thông tư 51/2025/TT-BTC chính thức có hiệu lực, mang theo một số thay đổi quan trọng trong việc nộp thuế điện tử cho hàng hóa xuất nhập khẩu. Cụ thể, sẽ có 04 phương thức nộp thuế điện tử mới được áp dụng, giúp doanh nghiệp linh hoạt hơn trong quá trình thanh toán nghĩa vụ thuế với cơ quan hải quan.
Nếu bạn đang hoạt động trong lĩnh vực xuất nhập khẩu hoặc đơn giản là muốn cập nhật để không bị “lỡ nhịp”, thì bài viết này sẽ giúp bạn nắm nhanh nội dung chính của Thông tư.
Chính thức áp dụng 04 phương thức nộp thuế điện tử theo Thông tư 51 cho hàng hóa xuất nhập khẩu?
Bộ Tài chính đã ban hành Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định thủ tục về giao dịch điện tử trong lĩnh vực thuế đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu, quá cảnh và phương tiện vận tải xuất cảnh, nhập cảnh, quá cảnh.
Theo đó, tại Điều 7 Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định:
Nộp thuế điện tử qua Cổng thanh toán điện tử hải quan
1. Người nộp thuế thực hiện lập chứng từ nộp ngân sách nhà nước
a) Người nộp thuế truy cập vào Cổng thanh toán điện tử hải quan tra cứu thông tin khoản phải nộp và lựa chọn khoản nộp ngân sách nhà nước, hệ thống hỗ trợ lập giấy nộp tiền vào ngân sách nhà nước theo mẫu ban hành kèm theo Nghị định số 11/2020/NĐ-CP. Người nộp thuế kiểm tra thông tin trên chứng từ nộp ngân sách nhà nước, lựa chọn ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán hoặc Kho bạc Nhà nước và ký số để yêu cầu trích tiền nộp ngân sách nhà nước.
Trường hợp tiền thuế phải nộp vào tài khoản thu khác nhau, thì lập riêng giấy nộp tiền vào ngân sách nhà nước tương ứng với từng tài khoản thu;
...
Đồng thời, Điều 8 Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định:
Nộp thuế điện tử qua ngân hàng, tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán phối hợp thu
1. Người nộp thuế truy cập vào Cổng trao đổi thông tin của ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán lựa chọn nộp ngân sách nhà nước và thực hiện lập chứng từ nộp ngân sách nhà nước theo mẫu ban hành kèm theo Nghị định số 11/2020/NĐ-CP.
Trường hợp người nộp thuế nộp tiền phí hải quan, lệ phí hàng hóa, phương tiện vận tải quá cảnh cho nhiều tờ khai, người nộp thuế thực hiện theo điểm c khoản 1 Điều 7 Thông tư này.
...
Tiếp đến, Điều 9 Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định:
Nộp thuế điện tử qua ngân hàng phối hợp thu đồng thời có ủy nhiệm thu với Kho bạc Nhà nước
1. Người nộp thuế truy cập vào Cổng trao đổi thông tin của ngân hàng và thực hiện lập chứng từ nộp ngân sách nhà nước theo mẫu ban hành kèm theo Nghị định số 11/2020/NĐ-CP.
Trường hợp người nộp thuế nộp tiền phí hải quan, lệ phí hàng hóa, phương tiện vận tải quá cảnh cho nhiều tờ khai, người nộp thuế thực hiện theo điểm c khoản 1 Điều 7 Thông tư này.
a) Trường hợp thông tin được lập phù hợp với thông tin truy vấn trên Cổng thanh toán điện tử hải quan, ngân hàng thực hiện trích tiền của người nộp thuế và truyền ngay thông tin thu đến Cổng thanh toán điện tử hải quan;
...
Cuối cùng, tại Điều 10 Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định:
Nộp thuế điện tử qua ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán chưa phối hợp thu với cơ quan hải quan
1. Người nộp thuế lập chứng từ nộp ngân sách nhà nước theo mẫu tại Phụ lục I ban hành kèm theo Nghị định số 11/2020/NĐ-CP trên hệ thống ứng dụng của ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán chưa phối hợp thu với cơ quan hải quan.
Trường hợp người nộp thuế nộp tiền phí hải quan, lệ phí hàng hóa, phương tiện vận tải quá cảnh cho nhiều tờ khai, người nộp thuế thực hiện theo điểm c khoản 1 Điều 7 Thông tư này.
...
Từ những quy định trên, có thể thấy hiện nay tại Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định có 04 phương thức nộp thuế điện tử đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu, quá cảnh và phương tiện vận tải xuất cảnh, nhập cảnh, quá cảnh; bao gồm:
(1) Nộp qua Cổng thanh toán điện tử Hải quan:
https://epayment.customs.gov.vn/epaymentportal/login.
(2) Nộp qua ngân hàng, tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán phối hợp thu.
(3) Nộp qua ngân hàng phối hợp thu đồng thời có ủy nhiệm thu với Kho bạc Nhà nước.
(4) Nộp qua ngân hàng hoặc tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán chưa phối hợp thu với cơ quan hải quan.
Hiệu lực thi hành
1. Thông tư này có hiệu lực kể từ ngày 7 tháng 8 năm 2025.
2. Tổ chức đã tham gia phối hợp thu với cơ quan hải quan trước thời điểm Thông tư này có hiệu lực thi hành thi tiếp tục thực hiện phối hợp thu với cơ quan hải quan.
3. Trong quá trình thực hiện, trường hợp các văn bản quy phạm pháp luật được viện dẫn tại Thông tư này được sửa đổi, bổ sung, thay thế thì áp dụng theo văn bản sửa đổi, bổ sung, thay thế đó./.
Theo quy định trên, có thể thấy Thông tư 51/2025/TT-BTC sẽ có hiệu lực thi hành từ 7/8/2025.
Như vậy, đồng nghĩa với việc 4 phương thức nộp thuế điện tử nêu trên sẽ chính thức được áp dụng từ 7/8/2025.
Thông tư 51/2025/TT-BTC được áp dụng cho những đối tượng nào?
Căn cứ Điều 2 Thông tư 51/2025/TT-BTC được áp dụng đối với đối tượng sau:
(1) Người nộp thuế theo quy định tại điểm a, điểm b khoản 1 Điều 2 Luật Quản lý thuế 2019
(2) Cơ quan hải quan theo quy định tại điểm b khoản 2 Điều 2 Luật Quản lý thuế 2019
(3) Kho bạc Nhà nước các cấp.
(4) Ngân hàng thương mại, ngân hàng liên doanh, ngân hàng 100% vốn nước ngoài, chi nhánh ngân hàng nước ngoài hoạt động tại Việt Nam, các tổ chức tín dụng khác thành lập và hoạt động theo quy định của Luật Các tổ chức tín dụng (sau đây gọi là ngân hàng), tổ chức cung ứng dịch vụ trung gian thanh toán.
(5) Cơ quan, tổ chức, cá nhân khác có liên quan giao dịch điện tử trong lĩnh vực thuế đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu, quá cảnh và phương tiện vận tải xuất cảnh, nhập cảnh, quá cảnh quy định tại Thông tư 51/2025/TT-BTC.
Chữ ký số trong giao dịch thuế điện tử đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu được quy định thế nào?
Căn cứ Điều 6 Thông tư 51/2025/TT-BTC quy định về chữ ký số trong giao dịch thuế điện tử đối với hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu như sau:
(1) Trong thực hiện giao dịch điện tử trong lĩnh vực thuế, người nộp thuế phải sử dụng chữ ký số đang còn hiệu lực theo quy định của pháp luật về giao dịch điện tử để ký các chứng từ điện tử, trừ các trường hợp sau:
- Người nộp thuế là cá nhân đã có mã số thuế chưa được cấp chữ ký số;
- Người nộp thuế lựa chọn phương thức nộp thuế điện tử quy định tại điểm b khoản 2 Điều 4 Thông tư 51/2025/TT-BTC thực hiện theo quy định của pháp luật về thanh toán không dùng tiền mặt.
(2) Người nộp thuế đăng ký chữ ký số với cơ quan hải quan theo quy định pháp luật về giao dịch điện tử, pháp luật về quản lý thuế để thực hiện nộp thuế điện tử trên Cổng thanh toán điện tử hải quan.
(3) Khi có thay đổi thông tin đã đăng ký với cơ quan hải quan, người nộp thuế thực hiện khai thay đổi thông tin trên Cổng thanh toán điện tử hải quan hoặc gửi thông tin thay đổi đến cơ quan hải quan để cập nhật thông tin trên hệ thống.
Kết luận
Việc triển khai 04 phương thức nộp thuế điện tử theo Thông tư 51/2025/TT-BTC không chỉ tạo thuận lợi lớn cho các doanh nghiệp và cá nhân tham gia hoạt động xuất nhập khẩu, mà còn thúc đẩy tính minh bạch, hiện đại hóa và hiệu quả trong quản lý thuế của cơ quan hải quan.
Hy vọng bài viết sẽ giúp bạn đọc - từ doanh nghiệp xuất nhập khẩu, đơn vị logistics, đến những bạn làm kế toán, thuế - nắm rõ hơn về quy định mới, lựa chọn phương thức phù hợp và chuẩn bị tốt khi chuyển đổi sang các phương thức điện tử.
Nếu bạn thấy nội dung hữu ích, đừng ngần ngại theo dõi chúng tôi để cập nhật thêm nhiều thông tin cũng như cơ hội việc làm tại AGS nhé.

.png)
