Doanh nghiệp thương mại điện tử đóng thuế TNDN như thế nào?

HCM Thùy ACC

14 thg 10, 2025

Bạn là chủ một doanh nghiệp thương mại điện tử, đang kinh doanh qua các nền tảng như Shopee, Lazada, Tiki, TikTok Shop, Facebook, website riêng... và bạn đang thắc mắc về nghĩa vụ đóng thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN)?

Hay bạn là kế toán viên mới vào nghề, được giao phụ trách doanh nghiệp TMĐT và đang loay hoay tìm hiểu cách tính và kê khai thuế TNDN cho mô hình kinh doanh này?

Bài viết dưới đây sẽ giúp bạn hiểu rõ bản chất thuế TNDN áp dụng cho doanh nghiệp thương mại điện tử, các quy định pháp lý liên quan, và những điểm cần lưu ý để thực hiện đúng và tránh rủi ro về thuế.

1. ✅ Doanh nghiệp thương mại điện tử có phải nộp thuế TNDN không?

Có. Theo quy định tại Luật Thuế thu nhập doanh nghiệp số 14/2008/QH12, sửa đổi bổ sung bởi Luật số 32/2013/QH13, mọi tổ chức sản xuất, kinh doanh hàng hóa, dịch vụ có thu nhập chịu thuế đều phải nộp thuế TNDN, bao gồm cả doanh nghiệp thương mại điện tử.

Mô hình TMĐT không làm thay đổi bản chất doanh thu – chi phí – lợi nhuận, nên thuế TNDN vẫn áp dụng như với các doanh nghiệp truyền thống, nhưng có một số đặc thù riêng.

2. 🧮 Cách tính thuế thu nhập doanh nghiệp với doanh nghiệp TMĐT

Công thức chung:

$\text{Thuế TNDN phải nộp} = \text{Thu nhập tính thuế} \times \text{Thuế suất}$

🔹 a. Thu nhập tính thuế

Thu nhập tính thuế được xác định như sau:

$Thu nhập t \overset{ˊ}{ı} nh thu \overset{ˊ}{\hat{e}} = Doanh thu - Chi ph \overset{ˊ}{ı} được trừ - L \tilde{\hat{o}} được k \overset{ˊ}{\hat{e}} t chuyển (n \overset{ˊ}{\hat{e}} u c \overset{ˊ}{o})$

Doanh thu: Là toàn bộ tiền bán hàng, cung cấp dịch vụ qua các nền tảng TMĐT. Bao gồm cả các khoản như phí vận chuyển thu hộ, chiết khấu thương mại nếu không tách riêng được.
Chi phí được trừ: Là các chi phí thực tế phát sinh phục vụ hoạt động kinh doanh, có chứng từ hợp lệ như hóa đơn, hợp đồng,… Ví dụ: chi phí quảng cáo Facebook, Google, phí sàn TMĐT, chi phí vận chuyển, tiền lương nhân viên, khấu hao tài sản, chi phí thuê kho, phần mềm, v.v.

⚠️ Lưu ý: Các khoản chi không có hóa đơn (như chạy quảng cáo không hợp lệ, lương trả bằng tiền mặt không có hợp đồng lao động…) sẽ không được tính vào chi phí hợp lý → làm tăng số thuế TNDN phải nộp.

🔹 b. Thuế suất áp dụng

Thuế suất phổ thông: 20% áp dụng cho hầu hết doanh nghiệp.
Thuế suất ưu đãi: Có thể thấp hơn nếu doanh nghiệp thuộc các đối tượng ưu đãi đầu tư, ngành nghề, địa bàn (xem thêm mục 5 bên dưới).

3. 📌 Kê khai và nộp thuế TNDN cho doanh nghiệp TMĐT

📅 Thời điểm kê khai và nộp thuế:

Tạm nộp hàng quý: Doanh nghiệp tự ước tính lợi nhuận trong quý và tạm nộp 75% số thuế TNDN cả năm trước 30/10.
Quyết toán thuế năm: Phải nộp chậm nhất 90 ngày kể từ ngày kết thúc năm tài chính (thường là ngày 31/03 năm sau).

📝 Hồ sơ cần nộp gồm:

Tờ khai quyết toán thuế TNDN (mẫu 03/TNDN)
Báo cáo tài chính năm
Thuyết minh báo cáo tài chính
Bảng kê các khoản chi phí không được trừ (nếu có)

4. ⚠️ Những rủi ro thường gặp ở doanh nghiệp TMĐT về thuế TNDN

Rủi ro phổ biến	Hệ quả
Không có hóa đơn chi phí chạy quảng cáo (Google, Facebook)	Không được tính vào chi phí → tăng thu nhập tính thuế
Bán hàng không xuất hóa đơn đầu ra	Có thể bị truy thu thuế + phạt hành chính
Gộp tiền cá nhân và công ty trong tài khoản thanh toán	Gây rối sổ sách kế toán, khó chứng minh chi phí hợp lệ
Không kê khai hoặc kê khai sai doanh thu từ sàn TMĐT	Dễ bị cơ quan thuế rà soát, truy thu

5. 🎁 Doanh nghiệp TMĐT có được hưởng ưu đãi thuế TNDN không?

Có thể có, nếu doanh nghiệp:

Đăng ký hoạt động tại khu vực kinh tế khó khăn hoặc đặc biệt khó khăn (ví dụ: một số huyện miền núi, Tây Nguyên…)
Hoạt động trong lĩnh vực công nghệ cao, đổi mới sáng tạo
Là doanh nghiệp khởi nghiệp đổi mới sáng tạo có chứng nhận từ cơ quan có thẩm quyền

Các ưu đãi có thể gồm:

Thuế suất ưu đãi 10% trong 15 năm, miễn thuế 4 năm đầu và giảm 50% thuế trong 9 năm tiếp theo (áp dụng tùy điều kiện).
Kết chuyển lỗ tối đa 5 năm liên tục tiếp theo

👉 Doanh nghiệp cần nộp hồ sơ đăng ký ưu đãi đúng hạn để được hưởng.

6. 🔍 Kết luận

Dù hoạt động trên nền tảng số, doanh nghiệp thương mại điện tử vẫn phải tuân thủ các quy định pháp luật thuế như doanh nghiệp truyền thống. Việc tính đúng, kê khai đầy đủ và nộp đúng hạn thuế thu nhập doanh nghiệp không chỉ giúp bạn tránh rủi ro pháp lý mà còn là cơ sở để phát triển doanh nghiệp bền vững.

👉 Nếu bạn chưa có bộ phận kế toán nội bộ, hãy cân nhắc sử dụng dịch vụ kế toán uy tín chuyên TMĐT, vì đặc thù chi phí và dòng tiền của ngành này có nhiều điểm khác biệt.

Công ty AGS cảm ơn bạn đã dành thời gian để đọc bài viết này. Hy vọng bạn đã có được những thông tin bô ích. Hãy tiếp tục theo dõi chúng tôi để cập nhật thêm nhiều thông tin cũng như cơ hội làm việc tại AGS nhé.