Case study: Doanh nghiệp bị truy thu thuế do giao dịch liên kết

VII NGOC ACC

21 thg 12, 2025

Một doanh nghiệp FDI trong lĩnh vực sản xuất linh kiện tử bị cơ quan thuế thanh tra. Tuy rằng là chi phí thật, giao dịch thật nhưng doanh nghiệp vẫn bị loại hơn 20 tỷ đồng chi phí và truy thu - phạt - chậm nộp tổng công 8,2 tỷ đồng.
Nguyên nhân không phải do gian lận. mà do sai sót trong kê khai và hồ sơ giao dịch liên kết.

1. Nguyên nhân 1: Không chứng minh được phí dịch vụ nội bộ

“Chi phí có thật, nhưng không chứng minh được lợi ích thực tế”.
Doanh nghiệp chi phí quản lý và hỗ trợ kỹ thuật cho công ty mẹ nước ngoài. Nhưng khi thanh tra yêu cầu hồ sơ:
- Không có báo cáo chi tiết dịch vụ,
- Không có email hay bằng chứng thực hiện,
- Không chứng minh được nhân sự nào, thời gian nào thực hiện dịch vụ.
Vì vậy, cơ quan thuế đã loại toàn bộ chi phí hơn 12 tỷ đồng vì “không chứng minh được lợi ích”.

2. Nguyên nhân 2: Không lập hồ sơ xác định giá giao dịch liên kết

“Có giao dịch mà không lập hồ sơ, thì sẽ bị ấn định thuế”.
Doanh nghiệp phát sinh giao dịch vay vốn nội bộ và mua linh kiện từ công ty liên kết.
Nhưng:
- Không lập hồ sơ Local file,
- Không nộp Master file khi được yêu cầu,
- Không có báo cáo so sánh giá thị trường (Benchmarking).
Kết quả, cơ quan thuế ấn định lại tỷ suất lợi nhuận 5% doanh thu, khiến thu nhập chịu thuế tăng thêm 15 tỷ đồng.

Sai 1 bước - Mất cả quả trình

Bài học rút ra ở đây là gì?
- Kê khai đúng thôi chưa đủ, doanh nghiệp phải có hồ sơ chứng minh hợp lý.
- Chi phí thật thôi chưa đủ, phải có chứng cứ dịch vụ và lợi ích kinh tế.
- Không lập hồ sơ theo chuẩn OECD, rủi ro ấn định thuế là chắc chắn.

Công ty AGS cảm ơn bạn đã dành thời gian để đọc bài viết này. Hy vọng bạn đã có được những thông tin bổ ích. Hãy tiếp tục theo dõi chúng tôi để cập nhật thêm nhiều thông tin cũng như cơ hội việc làm tại AGS nhé.